More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6372 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  68.99 
 
 		 557 aa  704    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  90 
 
 		 570 aa  995    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  100 
 
 		 569 aa  1133    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  69.17 
 
 		 557 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.84 
 
 		 539 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  46.63 
 
 		 562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.2 
 
 		 596 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  43.59 
 
 		 597 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  44.55 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.86 
 
 		 612 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  43.15 
 
 		 609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  42.42 
 
 		 610 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.57 
 
 		 547 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  40.97 
 
 		 599 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.23 
 
 		 568 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.84 
 
 		 531 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  45.41 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  43.99 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  42.7 
 
 		 601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.28 
 
 		 537 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.05 
 
 		 617 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.54 
 
 		 615 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  44.2 
 
 		 588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  42.96 
 
 		 541 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.39 
 
 		 593 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  45.24 
 
 		 568 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  44.48 
 
 		 625 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  44.79 
 
 		 550 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  43.99 
 
 		 595 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  44.61 
 
 		 547 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 550 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  43.68 
 
 		 611 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  43.28 
 
 		 538 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  42.88 
 
 		 553 aa  442  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  45.27 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 633 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  46.79 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 609 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  43.77 
 
 		 545 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  40.23 
 
 		 617 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  42.57 
 
 		 543 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.56 
 
 		 632 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 623 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  43.32 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  45.45 
 
 		 552 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  44.4 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.51 
 
 		 611 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.01 
 
 		 626 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.41 
 
 		 625 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  41.93 
 
 		 522 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  43.22 
 
 		 545 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  43.69 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.39 
 
 		 619 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  42.58 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  41.91 
 
 		 624 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.06 
 
 		 625 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  45.51 
 
 		 539 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  43.74 
 
 		 537 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  42.96 
 
 		 624 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 		 631 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 623 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.71 
 
 		 583 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 		 633 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.81 
 
 		 620 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 		 539 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  43.39 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.32 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 593 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  43.39 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  43.21 
 
 		 623 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  41.44 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.83 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 623 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  45.05 
 
 		 534 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  44.49 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  42.39 
 
 		 613 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 		 633 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.1 
 
 		 536 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  42.29 
 
 		 564 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.54 
 
 		 623 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  43.39 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40.81 
 
 		 578 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  43.75 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.97 
 
 		 610 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  41.45 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 		 627 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 536 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  42.7 
 
 		 536 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  45.29 
 
 		 540 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  42.19 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  44.18 
 
 		 534 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  45.35 
 
 		 552 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  44.95 
 
 		 544 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  41.48 
 
 		 611 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 		 623 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  42.17 
 
 		 623 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  41.91 
 
 		 640 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  42.93 
 
 		 611 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  43.97 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 		 623 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>