More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6258 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6258  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000084841  normal  0.418068 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4838  ABC transporter related  65.74 
 
 		 260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322693  normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4584  ABC transporter related  64.68 
 
 		 255 aa  334  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394882  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5261  ABC transporter related  58.23 
 
 		 279 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3232  ABC transporter related  58.23 
 
 		 279 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  49.8 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 247 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  53.44 
 
 		 240 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  51.81 
 
 		 242 aa  255  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  50.4 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  49.6 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  50.79 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  48.97 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  50 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  49.4 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  48.19 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  48.19 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  51 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  48.19 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  50.6 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  47.29 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.61 
 
 		 240 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  49.41 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  50.79 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  50.2 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  49 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  47.22 
 
 		 247 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  48.59 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.6 
 
 		 247 aa  247  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  48.59 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  50.81 
 
 		 246 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  49.01 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  47.83 
 
 		 259 aa  244  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  49.6 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  49.19 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  48.99 
 
 		 240 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  50.8 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  48.43 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  48.43 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  48.59 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  47.79 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  48.79 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  46.99 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  48.41 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.58 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  48.43 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  49.6 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  48.99 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.4 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  46.77 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.37 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  49.39 
 
 		 243 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 240 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  49 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  48.8 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  47.39 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  47.24 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  48 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  47.39 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  47.24 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  46.85 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  49.19 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 269 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  51 
 
 		 249 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  48.8 
 
 		 243 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  47.62 
 
 		 258 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  49.6 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  47.18 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  49.02 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  48.99 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  48.79 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  50.2 
 
 		 240 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.4 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.39 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  49.19 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  47.39 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  48.16 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  49.21 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.59 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  49.21 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>