More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4677 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 507 aa  1019    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  82.91 
 
 		 509 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  30.02 
 
 		 487 aa  223  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  29.6 
 
 		 487 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  29.25 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  29.4 
 
 		 487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  29.26 
 
 		 559 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  29.26 
 
 		 559 aa  217  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  28.78 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 487 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  28.92 
 
 		 487 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  27.94 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  28.26 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 459 aa  180  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  25.75 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 384 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  28.82 
 
 		 459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 493 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 551 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 516 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 566 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  29.05 
 
 		 548 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  29.05 
 
 		 548 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  29.05 
 
 		 548 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.76 
 
 		 552 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 554 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 539 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 		 525 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  29.69 
 
 		 587 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  30.73 
 
 		 547 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 499 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  28.46 
 
 		 560 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 544 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.21 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  29.89 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  30.05 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  28.53 
 
 		 564 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  29.6 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  26.26 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.38 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  28.27 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 558 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  28.07 
 
 		 546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  28.61 
 
 		 552 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 527 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  30.71 
 
 		 605 aa  127  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 545 aa  127  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  31.22 
 
 		 532 aa  127  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  28.8 
 
 		 552 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 1043 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  28.81 
 
 		 596 aa  127  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 		 506 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 2374 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.57 
 
 		 550 aa  126  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  28.06 
 
 		 503 aa  126  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  27.93 
 
 		 546 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 534 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  31.18 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  30.23 
 
 		 560 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.99 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  28.65 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.12 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  30.14 
 
 		 576 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  27.85 
 
 		 535 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 517 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  28.06 
 
 		 568 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  27.66 
 
 		 530 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  27.29 
 
 		 584 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  27.71 
 
 		 504 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  29.13 
 
 		 549 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  31.45 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  28.86 
 
 		 548 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.17 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  31.45 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.3 
 
 		 538 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 487 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 2376 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1955  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 503 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 578 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  28.85 
 
 		 549 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  28.36 
 
 		 573 aa  123  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  28.95 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>