228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2858 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 124 aa  254  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  97.58 
 
 		 124 aa  249  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  64.23 
 
 		 123 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  63.11 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  60.16 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  60.66 
 
 		 126 aa  153  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  60.98 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  55.65 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  60.98 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  61.67 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  52.5 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4188  DGPFAETKE family protein  59.66 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1379  DGPFAETKE family protein  48.33 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  33.87 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  37.19 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  38.94 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  38.05 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  36.13 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  32.48 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  36.13 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  36.75 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  38.94 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  35.04 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  36.67 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  34.51 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  34.51 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  34.45 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  33.04 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  34.45 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  37.35 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  35.65 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  37.35 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  35.58 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  42.67 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  36.54 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  35.58 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  36.27 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  33.93 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  32.97 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  35.14 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  31.86 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  34.62 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  32.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  31.15 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  32.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  33.71 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  32.29 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  36.19 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  36.9 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  33.7 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  32.46 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  40.96 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  32 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  44 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  35.8 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  39.32 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  46.48 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  30.36 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  34.69 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  30.25 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  32.04 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  33.33 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  29.2 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  33.73 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  36.67 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  30.43 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  35.56 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  31.91 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  38.27 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  28.93 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  40.58 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  36.36 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  36.17 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  39.53 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  29.91 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  29.31 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  31.58 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  29.25 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  31.73 
 
 		 246 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  29.25 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  33.65 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  37.04 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  29.46 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  34.02 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  29.25 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  29.25 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  29.25 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  29.25 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  41.43 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  32.58 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  31.73 
 
 		 243 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  32.58 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  32.58 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>