104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1024 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 680 aa  1324    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1176  Peptidoglycan-binding LysM  87.68 
 
 		 676 aa  1086    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0861609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  42.26 
 
 		 663 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  46.06 
 
 		 572 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  37.66 
 
 		 428 aa  171  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  38.33 
 
 		 404 aa  160  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  37.8 
 
 		 404 aa  157  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  32.66 
 
 		 552 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  31.67 
 
 		 511 aa  99  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  58.82 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  31.07 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  30.63 
 
 		 451 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  24.58 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  67.35 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  26.87 
 
 		 322 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  55.56 
 
 		 439 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  36.52 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  47.83 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  31.34 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  52.94 
 
 		 651 aa  66.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  40.26 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  41.67 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  24.55 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2193  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 1051 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 367 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  34.67 
 
 		 219 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 166 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  38.3 
 
 		 166 aa  51.2  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  40.28 
 
 		 234 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 195 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 157 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 167 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  38.6 
 
 		 146 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 318 aa  47.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 242 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  41.07 
 
 		 146 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 230 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  34.92 
 
 		 148 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1090 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  36.07 
 
 		 168 aa  46.2  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  36.07 
 
 		 168 aa  46.6  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  38.3 
 
 		 185 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 		 168 aa  46.2  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  41.82 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 158 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 153 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  39.34 
 
 		 364 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  40 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  39.66 
 
 		 158 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  38 
 
 		 145 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 162 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 395 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 162 aa  45.8  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 154 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  38.78 
 
 		 243 aa  45.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 145 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2211  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.67 
 
 		 500 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00497018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  42.03 
 
 		 5561 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  39.39 
 
 		 546 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  28.67 
 
 		 500 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  43.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  43.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  43.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  42.03 
 
 		 5559 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  42.03 
 
 		 5561 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  42.03 
 
 		 5561 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  42.03 
 
 		 5559 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  38.46 
 
 		 229 aa  44.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 146 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 163 aa  44.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  34.92 
 
 		 167 aa  44.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  28.1 
 
 		 334 aa  44.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.3  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  28.1 
 
 		 334 aa  44.3  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 150 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2902  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 230 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000393442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 146 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 		 389 aa  43.9  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  40.43 
 
 		 156 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  38.78 
 
 		 146 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>