More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1017 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 144 aa  290  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  88.06 
 
 		 138 aa  213  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  64.18 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  57.03 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  38.76 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  38.76 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 473 aa  75.5  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.68 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  32.79 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.23 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  30.16 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  37.14 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33.61 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  32.77 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  32.26 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33.61 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  30.89 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.61 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.61 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  30.89 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  30.7 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  30.7 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  30.7 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  28.91 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.61 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  29.55 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.75 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.75 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.46 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  34.48 
 
 		 329 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  34.48 
 
 		 329 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>