41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0783 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  937    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  37.7 
 
 		 638 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  35.87 
 
 		 821 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  32.82 
 
 		 834 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  36.78 
 
 		 676 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  32.23 
 
 		 836 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  37.8 
 
 		 819 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  32.01 
 
 		 836 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  32.05 
 
 		 826 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  33.48 
 
 		 826 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  33.18 
 
 		 840 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  32.94 
 
 		 851 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  33.58 
 
 		 829 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  31.38 
 
 		 843 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  33.98 
 
 		 829 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  32.95 
 
 		 837 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  32 
 
 		 851 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  33.58 
 
 		 829 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  32.16 
 
 		 830 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  37.34 
 
 		 807 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  32.78 
 
 		 811 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  34.73 
 
 		 818 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  38.89 
 
 		 817 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  33.51 
 
 		 851 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 820 aa  143  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  33.18 
 
 		 838 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  33.51 
 
 		 1209 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  33.72 
 
 		 837 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  33.25 
 
 		 1209 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  29.74 
 
 		 878 aa  126  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  34.16 
 
 		 651 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  36.51 
 
 		 835 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  30.81 
 
 		 1237 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  29.94 
 
 		 1224 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  29.41 
 
 		 1224 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  29.41 
 
 		 1224 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  28.24 
 
 		 366 aa  99.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  28.15 
 
 		 638 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  35.87 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  33.33 
 
 		 948 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  32.14 
 
 		 951 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>