More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6463 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.42 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  55.3 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  52.41 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.14 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 		 355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.14 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 		 358 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.85 
 
 		 353 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.57 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.43 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.41 
 
 		 355 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.69 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  47.43 
 
 		 357 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  48.72 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.58 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.72 
 
 		 355 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.59 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.15 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.72 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  49.44 
 
 		 355 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.41 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.73 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  49 
 
 		 352 aa  315  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  46.33 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  46.44 
 
 		 357 aa  308  8e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 		 352 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.46 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.11 
 
 		 848 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.35 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.17 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 354 aa  222  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 417 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 		 380 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  27.51 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  27.51 
 
 		 385 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 394 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.84 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.98 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.23 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  26.98 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  26.98 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.98 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.77 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3875  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.98 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.98 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  26.02 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.98 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.67 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.7 
 
 		 383 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.65 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.59 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.35 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  26.74 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4537  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  26.88 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.41 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5421  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 372 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.08 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.08 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.08 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.08 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  26.7 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.88 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.85 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.13 
 
 		 383 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.9 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  25.98 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>