143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3358 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  78.57 
 
 
292 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  60.43 
 
 
297 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  60.07 
 
 
297 aa  332  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  59.71 
 
 
301 aa  328  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  47.4 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  46.23 
 
 
296 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  49.23 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  45.8 
 
 
310 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  43.01 
 
 
299 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  44.53 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  44.53 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  44.53 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  47.31 
 
 
312 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  44.53 
 
 
302 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  46.12 
 
 
281 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  44.53 
 
 
302 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  44.53 
 
 
302 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  47.31 
 
 
312 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  43.17 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  47.66 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  46.32 
 
 
281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  39.72 
 
 
285 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  42.03 
 
 
310 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  40.51 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  41.2 
 
 
321 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  38.55 
 
 
286 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  40.29 
 
 
296 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  40.23 
 
 
312 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  39.73 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  39.64 
 
 
298 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  37.19 
 
 
340 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  39.27 
 
 
298 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  39.27 
 
 
298 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  38.55 
 
 
298 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  40.46 
 
 
319 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  37.89 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  37.23 
 
 
296 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  37.23 
 
 
296 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  36.69 
 
 
296 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 
295 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  37 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  36.16 
 
 
314 aa  162  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  35.27 
 
 
295 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  36.63 
 
 
286 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  36.92 
 
 
293 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  35.74 
 
 
287 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  36.52 
 
 
293 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  34.18 
 
 
295 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  37.13 
 
 
285 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  35.82 
 
 
293 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  38.41 
 
 
296 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  35.04 
 
 
295 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  35.77 
 
 
295 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.9 
 
 
294 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  38.43 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  33.92 
 
 
295 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  34.4 
 
 
295 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.81 
 
 
287 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  35.29 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  32.86 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  33.73 
 
 
286 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  31.66 
 
 
271 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  28.91 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  29.92 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 
265 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 
267 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 
344 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 
267 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 
267 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 
267 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  28.91 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  29.69 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  25.74 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  29.29 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  28.99 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  28.97 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  27.08 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  29.25 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  27.08 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  26.67 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  26.67 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  25.83 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  28.15 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  26.1 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.44 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  28.79 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>