52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1911 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  59.34 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  65.28 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  57.69 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  51.61 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  39.73 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  34.48 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4541  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5937  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496478  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5997  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.71 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5133  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.93216  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1519  transcriptional regulator, XRE family  24.19 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0937641 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  29.51 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0677  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  35.62 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0649  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0705  Cro/CI family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1316  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0557  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 78 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.948289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3396  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 91 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0669  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>