139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0813 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0813  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2644  hypothetical protein  70.66 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0785  protein of unknown function DUF72  60.68 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.223922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0715  protein of unknown function DUF72  60.57 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.0915207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0765  hypothetical protein  62.26 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.143157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2489  hypothetical protein  51.01 
 
 		 440 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457254  normal  0.59095 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2618  hypothetical protein  50.72 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0512  hypothetical protein  50.6 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204603  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2570  hypothetical protein  53.23 
 
 		 433 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3223  protein of unknown function DUF72  50.9 
 
 		 489 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.873397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1959  hypothetical protein  53.23 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0726  hypothetical protein  52.45 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.299364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5902  hypothetical protein  53.29 
 
 		 431 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2594  hypothetical protein  51.59 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0739  hypothetical protein  51.54 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0715  hypothetical protein  50.59 
 
 		 505 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0023847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0357  hypothetical protein  51.07 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000555141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0657  hypothetical protein  51.07 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2492  hypothetical protein  51.07 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000876051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0105  hypothetical protein  51.07 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0559982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0902  hypothetical protein  50.76 
 
 		 525 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1059  hypothetical protein  50.76 
 
 		 519 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0899  hypothetical protein  50.76 
 
 		 525 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2789  protein of unknown function DUF72  49.84 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0971015  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1999  protein of unknown function DUF72  47.73 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1704  hypothetical protein  47.73 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.792663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1869  hypothetical protein  46.48 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1823  hypothetical protein  43.16 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.599232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0200  protein of unknown function DUF72  41.79 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3371  hypothetical protein  39.14 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241512  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1934  protein of unknown function DUF72  31.36 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.978403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3869  hypothetical protein  26.69 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0151783 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  26.94 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  25.76 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  28.77 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  25.12 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  26.11 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  25.37 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  28.26 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  30.05 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  28.64 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  28.44 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  25.12 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  29.38 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  25.62 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  25.37 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  23.65 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  30.1 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  24.26 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  31.58 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  25.12 
 
 		 267 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  25.36 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  25.63 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  25.95 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  29.95 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  25.12 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  24.87 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  29.8 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  28.37 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  23.67 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  26.57 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  27.83 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  31.58 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  26.34 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  24.86 
 
 		 268 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  26.57 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  24.14 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  27.4 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  23.12 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  26.47 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  26.21 
 
 		 241 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  24.38 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  30.86 
 
 		 254 aa  53.5  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  26.86 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  26.87 
 
 		 249 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  30.53 
 
 		 249 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  26.6 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  30.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  26.13 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  24.02 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.05 
 
 		 243 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  26.39 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  28.64 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  27.27 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  25.84 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  27.23 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  29.54 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  29.17 
 
 		 240 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32 
 
 		 244 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  26.24 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  22.28 
 
 		 265 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  25.91 
 
 		 322 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  26.04 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  25.45 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  27.36 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  27.41 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  25.94 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  21.92 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  22.77 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>