298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0632 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  78.28 
 
 		 490 aa  775    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  74.74 
 
 		 491 aa  702    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  66.25 
 
 		 489 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  100 
 
 		 490 aa  983    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  47.83 
 
 		 797 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.07 
 
 		 787 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  45.11 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  47.58 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.32 
 
 		 776 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  42.63 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  42.35 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  48.45 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.49 
 
 		 772 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.74 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  43.23 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  45.21 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  46.27 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  49.01 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  45.8 
 
 		 491 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.03 
 
 		 777 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  46.19 
 
 		 532 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.74 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  49.01 
 
 		 481 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  47.58 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  46.89 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  44.49 
 
 		 864 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  42.91 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  45.49 
 
 		 491 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  46.51 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  43.17 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  46.36 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.31 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  43 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  43.11 
 
 		 512 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  46.83 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  42.42 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  44.14 
 
 		 863 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  42.01 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  47.17 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  43.61 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  44.83 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  47.91 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.1 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  46.75 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  43.61 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.1 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  46.98 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  45.7 
 
 		 495 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  45.53 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  46.83 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.31 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  44.14 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  45.92 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  46.68 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.89 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  47.15 
 
 		 496 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  41.63 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  41.53 
 
 		 539 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  44.38 
 
 		 488 aa  362  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  46.27 
 
 		 500 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  42.4 
 
 		 863 aa  362  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  43.6 
 
 		 490 aa  362  9e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  45.45 
 
 		 480 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  47.22 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2571  cobyric acid synthase  47.38 
 
 		 484 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  45.63 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  47.41 
 
 		 489 aa  359  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  43.47 
 
 		 495 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  44.82 
 
 		 491 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  46.27 
 
 		 491 aa  356  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  39.69 
 
 		 513 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  45.64 
 
 		 500 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  43.71 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  39.35 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  46.7 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  40.35 
 
 		 509 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  39.96 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  45.35 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  47.66 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  39.25 
 
 		 509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  41.14 
 
 		 501 aa  353  5e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  45.74 
 
 		 509 aa  352  7e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  41.06 
 
 		 503 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  41.37 
 
 		 852 aa  351  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  43.66 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  42.98 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  45.28 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  41.58 
 
 		 487 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  47.69 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0634  cobyric acid synthase  45.53 
 
 		 495 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0946562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  46.57 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  46.92 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  41.36 
 
 		 487 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  40.5 
 
 		 485 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4257  cobyric acid synthase  44.02 
 
 		 524 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  47.19 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  44.76 
 
 		 512 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  38.78 
 
 		 494 aa  346  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>