228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0097 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  86.78 
 
 		 485 aa  838    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 483 aa  966    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  72.2 
 
 		 480 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  75.28 
 
 		 478 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  75.8 
 
 		 486 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  88.17 
 
 		 485 aa  832    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  67.22 
 
 		 470 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  62.42 
 
 		 478 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  63.06 
 
 		 509 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  63.04 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  62.86 
 
 		 577 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  63.06 
 
 		 479 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  63.04 
 
 		 476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  62.83 
 
 		 476 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  62.83 
 
 		 476 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  56.7 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  57.65 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  56.76 
 
 		 467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  56.76 
 
 		 467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  56.32 
 
 		 467 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  56.32 
 
 		 467 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  56.32 
 
 		 467 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  56.32 
 
 		 467 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  56.32 
 
 		 467 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  55.78 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  56.19 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  56.19 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  51.24 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  54.62 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  52.06 
 
 		 467 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  55.7 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  40.33 
 
 		 505 aa  299  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  38.28 
 
 		 545 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  38.28 
 
 		 545 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  38.28 
 
 		 545 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  38.28 
 
 		 545 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  38.1 
 
 		 546 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  37.92 
 
 		 546 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  38.21 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  38.05 
 
 		 616 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  38.6 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  37.32 
 
 		 545 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  39.66 
 
 		 501 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  38 
 
 		 532 aa  279  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  37.75 
 
 		 527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  38.49 
 
 		 496 aa  274  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  38.03 
 
 		 543 aa  273  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  38.11 
 
 		 496 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  39.31 
 
 		 548 aa  269  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  37.89 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  37.82 
 
 		 640 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  37.76 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  36.54 
 
 		 501 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  36.54 
 
 		 498 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  36.54 
 
 		 498 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  36.54 
 
 		 498 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  37.16 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  34.83 
 
 		 552 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  36.52 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  36.2 
 
 		 527 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  36.4 
 
 		 498 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 498 aa  257  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  36.8 
 
 		 527 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  37.37 
 
 		 535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  34.99 
 
 		 568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  37.12 
 
 		 568 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  36.93 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  36.13 
 
 		 565 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  35.53 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  32.56 
 
 		 434 aa  199  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  32.77 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  38.82 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  34.63 
 
 		 671 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  33.03 
 
 		 433 aa  193  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  36.14 
 
 		 560 aa  185  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  33.41 
 
 		 589 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  37.93 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  38 
 
 		 541 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  30.21 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  36.72 
 
 		 558 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  35.69 
 
 		 676 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  35.78 
 
 		 536 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  30.83 
 
 		 584 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  35.85 
 
 		 335 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  35.26 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  32.24 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  31.39 
 
 		 582 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  30.85 
 
 		 609 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  30.34 
 
 		 584 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  34.53 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  30.14 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  29.58 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  28.66 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  28.66 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  29.19 
 
 		 584 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  28.46 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  29.46 
 
 		 581 aa  156  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  35.75 
 
 		 525 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  30.35 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  31.42 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>