More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0378 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  867    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  87.99 
 
 		 433 aa  772    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  99.08 
 
 		 433 aa  861    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  66.21 
 
 		 436 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  62.44 
 
 		 436 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  57.75 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  54.04 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  48.93 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  47.41 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  45.97 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  44.87 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  45.97 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  45.73 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  45.08 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 433 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  45.26 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 433 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  42.55 
 
 		 427 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  45.41 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  42.79 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  42.55 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 427 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 427 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 427 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  44.66 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  46.59 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  45.9 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  44.42 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 432 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  40.95 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  42.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  42.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 437 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  41.27 
 
 		 427 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.59 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  45.52 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.12 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 430 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 428 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 428 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  46.57 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  47.43 
 
 		 430 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  44.19 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 428 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  46.83 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  41.09 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  45.61 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  47.64 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  40.57 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  46.19 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  45.84 
 
 		 428 aa  322  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 426 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  44.66 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  43.33 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  43.09 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 427 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  41.61 
 
 		 435 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 433 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 431 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 449 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>