257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1668 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  75.28 
 
 		 623 aa  959    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  84.59 
 
 		 623 aa  1057    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  68.64 
 
 		 626 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 623 aa  1228    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  53.19 
 
 		 619 aa  618  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  52.4 
 
 		 622 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  49.03 
 
 		 611 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  38.02 
 
 		 613 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  37.9 
 
 		 623 aa  359  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  39.31 
 
 		 632 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  39.31 
 
 		 632 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  38.44 
 
 		 632 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  38.91 
 
 		 623 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  38.73 
 
 		 618 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  36.8 
 
 		 627 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  32.81 
 
 		 599 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  32.34 
 
 		 588 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  30.73 
 
 		 588 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  31.26 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  29.98 
 
 		 587 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  32.24 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.13 
 
 		 727 aa  124  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 		 637 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  31.84 
 
 		 457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  29.76 
 
 		 484 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  27.01 
 
 		 644 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  30.89 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.35 
 
 		 920 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.39 
 
 		 847 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  24.36 
 
 		 614 aa  106  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 554 aa  105  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 554 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 		 548 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  31.8 
 
 		 457 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  27.64 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  30.51 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.17 
 
 		 458 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  27.98 
 
 		 647 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  30.51 
 
 		 715 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.4 
 
 		 546 aa  98.6  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  28.99 
 
 		 653 aa  98.6  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  30.98 
 
 		 457 aa  97.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  24.32 
 
 		 846 aa  97.4  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 818 aa  97.4  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  28.92 
 
 		 495 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  23.17 
 
 		 838 aa  96.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  25.86 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.25 
 
 		 623 aa  95.5  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  27.87 
 
 		 486 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  27.76 
 
 		 495 aa  95.1  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.29 
 
 		 682 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 493 aa  94.4  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  26.07 
 
 		 696 aa  94  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  27.92 
 
 		 690 aa  94  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 		 683 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 		 456 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 		 688 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  26.04 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  27.76 
 
 		 487 aa  92.8  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  24.37 
 
 		 638 aa  91.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  24.56 
 
 		 858 aa  91.3  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  24.42 
 
 		 640 aa  91.3  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  24.56 
 
 		 858 aa  90.9  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  30.82 
 
 		 489 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  25.39 
 
 		 481 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 465 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  29.7 
 
 		 531 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  30.1 
 
 		 486 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  24.63 
 
 		 685 aa  90.1  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  31.62 
 
 		 660 aa  89.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.23 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  26 
 
 		 547 aa  89  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 		 583 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 		 480 aa  87.8  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 697 aa  87.8  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  26.33 
 
 		 695 aa  87.8  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 		 657 aa  87.8  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 481 aa  87.8  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  27.04 
 
 		 485 aa  87.4  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  25.66 
 
 		 547 aa  87  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 		 547 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 		 613 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  25.41 
 
 		 547 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 		 547 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.67 
 
 		 464 aa  87  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  23.75 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  23.08 
 
 		 568 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  23.05 
 
 		 637 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  26.07 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>