234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0195 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 397 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  79.08 
 
 		 393 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  78.79 
 
 		 393 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  73.8 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  73.79 
 
 		 394 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  69.52 
 
 		 394 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  71.03 
 
 		 394 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  59.05 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  59.3 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  60.31 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  56.59 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  55.61 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  57.93 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  56.56 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  59.13 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  59.13 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  53.87 
 
 		 409 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  53.07 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  52.53 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  52.39 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  55.41 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  51.85 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  50.79 
 
 		 386 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  51.9 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  51.44 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  46.09 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  48.23 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  44.82 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.01 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  47.34 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  43.9 
 
 		 368 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  48.93 
 
 		 371 aa  296  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  47.07 
 
 		 379 aa  295  8e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  45.57 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  46.09 
 
 		 389 aa  292  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  45.75 
 
 		 358 aa  292  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  42.51 
 
 		 358 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  42.23 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  42.55 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  41.22 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  42.35 
 
 		 354 aa  276  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  41.69 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  42.01 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  40.97 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  42.01 
 
 		 360 aa  259  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  39.02 
 
 		 360 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  38.85 
 
 		 374 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  38.44 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  38.34 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  38.87 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  37.63 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  41.82 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  39.78 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  39.63 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  39.78 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.15 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  40.91 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  40.05 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  38.79 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.63 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  37.63 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  39.08 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  37.63 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  39.37 
 
 		 374 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  37.63 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  39.38 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  39.68 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  38.92 
 
 		 391 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  40.16 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  39.37 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  40.32 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  39.78 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  40.54 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  39.79 
 
 		 374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  40.32 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  40.7 
 
 		 361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  39.89 
 
 		 364 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  38.24 
 
 		 368 aa  245  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  37.63 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  37.63 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  40.75 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  39.89 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  37.63 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  40.59 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  40.75 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  40.75 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  40 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.17 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  38.95 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  40.75 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  40.75 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  40.48 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  40.75 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  40.75 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  35.98 
 
 		 372 aa  242  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  37.11 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  40.21 
 
 		 365 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  38.77 
 
 		 370 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  39.02 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>