247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3940 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3701  Hly-III related proteins  96.12 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  87.88 
 
 		 231 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4269  Hly-III related proteins  70.34 
 
 		 236 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673544  normal  0.633803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  70.42 
 
 		 224 aa  305  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6673  hemolysin III  61.74 
 
 		 231 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0078  Hly-III family protein  61.06 
 
 		 218 aa  241  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0068  hemolysin III family channel protein  60.1 
 
 		 218 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  59.13 
 
 		 218 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  54.76 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  51.82 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  54.03 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  51.83 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  50.22 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0605  Hly-III family protein  48.57 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0995  Hly-III family protein  51.21 
 
 		 222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0867  Hly-III family protein  50.49 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296032  normal  0.935947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1271  Hemolysin III  51.72 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5862  Hly-III family protein  51.34 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  38.1 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  40.58 
 
 		 212 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4657  Hly-III family protein  41.29 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  35.48 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0525  hypothetical protein  42.65 
 
 		 219 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2177  Hly-III family protein  42.65 
 
 		 219 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00438954  normal  0.0630884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0547  Hly-III related proteins  40.48 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  39.11 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  37.21 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  38.42 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  37.86 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  36.67 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  37.1 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  37.14 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  38.73 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  38.73 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  38.73 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  35.71 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  38.73 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  38.73 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  36.65 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  32.89 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  36.45 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  33.99 
 
 		 213 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  34.3 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  33.98 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1262  Hly-III family protein  41.06 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03334  hemolysin III  37.11 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  35.78 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  39.11 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  39.11 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  39.11 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  32.51 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  40.12 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  35.82 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  34.98 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  36.1 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  33.97 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  33.8 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  35.82 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  35.1 
 
 		 518 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  35.82 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  36.68 
 
 		 214 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  36.82 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  32.2 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  35.32 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  32.34 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  34.83 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  33.19 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  36.18 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  36.14 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  36.94 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  33.64 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  35.1 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  34.3 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  35.15 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  31 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  32.04 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  31.19 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  37.71 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  33.8 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  29.95 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  33.66 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  36.2 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0904  Hly-III family protein  40 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  31.12 
 
 		 208 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  33.51 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  33.03 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  33.51 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  34.16 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>