72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1220 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 327 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  85.93 
 
 		 327 aa  590  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  69.16 
 
 		 331 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  60.13 
 
 		 329 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  53.55 
 
 		 317 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  53.82 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  53.54 
 
 		 317 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  49.67 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  51.67 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  48.16 
 
 		 343 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  48.44 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  47.75 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 293 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  33.16 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  22.67 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.53 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  27.32 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  24.58 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.8 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.31 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.88 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000065043  decreased coverage  0.000121837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.11 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0185  hypothetical protein  25.27 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  25.21 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.13 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.41 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  25.53 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  25.09 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  24.73 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4818  predicted protein  25 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  22.54 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  28.7 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  23.37 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>