47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0199 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  61.57 
 
 		 658 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  43.22 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  43.9 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  35.87 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  28.79 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  33.64 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  36.56 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  36.41 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  37.22 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  36.41 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  35.44 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  38.17 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  33.85 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  34.18 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  37.14 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  31.53 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  37.14 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  33.18 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  37.1 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  32.95 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  32.95 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  31.79 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  33.78 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  35.64 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  33.01 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  33.01 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  32.78 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  33.01 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  34.27 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  33.57 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  33.02 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  31.87 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  30.05 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  28.49 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  28.93 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  27.67 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  27.72 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  29.76 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  29.19 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  25.76 
 
 		 220 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  27.31 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  31.46 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  30.86 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.41 
 
 		 386 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  26.06 
 
 		 289 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>