More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1142 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1142  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
145 aa  290  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.143117  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2508  MgtC/SapB transporter  80 
 
 
147 aa  229  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0205  MgtC/SapB transporter  80.28 
 
 
143 aa  228  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0249052  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3306  MgtC/SapB transporter  59.44 
 
 
157 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  53.91 
 
 
158 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0591  MgtC/SapB transporter  53.24 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0259  hypothetical protein  46.56 
 
 
185 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.448528 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  35.38 
 
 
227 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  39.34 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  32.82 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  33.08 
 
 
162 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  38.98 
 
 
215 aa  76.6  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  33.1 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  32.37 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  31.88 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  37.07 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  38.83 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  38.83 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  38.83 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  38.83 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  35.71 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  35.71 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  35.71 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  34.07 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  34.07 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  35.71 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  35.71 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  35.71 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  35.25 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  35.25 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  35.25 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 
235 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  34.07 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  36.64 
 
 
221 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  36.11 
 
 
212 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  34.92 
 
 
215 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  34.59 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  34.59 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  29.45 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  35.34 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  38.21 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  40 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  36.62 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  36.54 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  37.25 
 
 
235 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  35.54 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  40 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  36.89 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  36.89 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  36.89 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  36.89 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  36.89 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2114  MgtC/SapB transporter  33.82 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170064 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  36.89 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  36.89 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  36.89 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  33.57 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  39.36 
 
 
239 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  30.6 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  32.11 
 
 
224 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  36.07 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  34.88 
 
 
245 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  36.29 
 
 
233 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  33.33 
 
 
225 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  33.04 
 
 
225 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  37.61 
 
 
230 aa  70.1  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  36.54 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  33.33 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  34.85 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  35.65 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  34.21 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  39.81 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  38.46 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  34.81 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7258  putative MgtC family protein  39.17 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  37.74 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  33.83 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  33.85 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  39.36 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  34.31 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  29.66 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  35.11 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  35.24 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  30.71 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  36.07 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  35 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  29.08 
 
 
238 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  36.07 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  35.25 
 
 
233 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  35.25 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  35 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0206  MgtC/SapB transporter  38.32 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  40.22 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  32.67 
 
 
225 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>