202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2050 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  78.01 
 
 		 423 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 439 aa  920    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  63.28 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  59.85 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  60.1 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  59.85 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  36.02 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  32.33 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  33.81 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  36.76 
 
 		 440 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  33.49 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  33.88 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  33.02 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  32.55 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  33.8 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  33.72 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  34.82 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  32.08 
 
 		 438 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  32.08 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  32.08 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  32.08 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  32.08 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 437 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  33.64 
 
 		 442 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  31.84 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  33.02 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  33.41 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  30.84 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  33.95 
 
 		 437 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  33.56 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  33.41 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  30.84 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  32.68 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  32.16 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  33.18 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  30.9 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  32.78 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  32.09 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  31.4 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  30.56 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  30.4 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  30.13 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.96 
 
 		 445 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  33.49 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  30.95 
 
 		 432 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  30.14 
 
 		 447 aa  196  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  29.07 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  29.28 
 
 		 486 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  26.64 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  27.03 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  38.94 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.86 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  31.41 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  28.47 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.82 
 
 		 449 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  27.91 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  28.47 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  26.11 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.84 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.34 
 
 		 429 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  27.12 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  26 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  24.88 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.13 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.9 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  34.65 
 
 		 574 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  28.37 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  24.83 
 
 		 572 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  23.68 
 
 		 556 aa  97.1  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  21.92 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.69 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  22.17 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  26.54 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1024 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  37.17 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  21.16 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0929  cholesterol oxidase  26.32 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  21.4 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  21.13 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0751  FAD binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0762  FAD binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.30819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.38 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  20.99 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  21.96 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.45 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.56 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.61 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  21.96 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0619  cholesterol oxidase  26.17 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  27.23 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  21.14 
 
 		 471 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  23.16 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  28.74 
 
 		 558 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0725  hypothetical protein  25.47 
 
 		 584 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10370  hypothetical protein  29.81 
 
 		 597 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>