294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4086 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  94.16 
 
 		 566 aa  938    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  94.16 
 
 		 548 aa  936    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  83.58 
 
 		 543 aa  829    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 548 aa  1065    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  93.43 
 
 		 548 aa  967    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  62.41 
 
 		 581 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  62.59 
 
 		 553 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  63.49 
 
 		 545 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  49.28 
 
 		 551 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  49.46 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  47.64 
 
 		 548 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  46.58 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  46.28 
 
 		 548 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  46.35 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  46.35 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  46.35 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  46.35 
 
 		 548 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  48.47 
 
 		 554 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  46.35 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  48 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  46.4 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  46.4 
 
 		 633 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  46.22 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  46.4 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  46.04 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  46.81 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  47.82 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  47.82 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  47.82 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  45.93 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  45.75 
 
 		 549 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  45.93 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  45.93 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  45.93 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  45.93 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  46.29 
 
 		 549 aa  415  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  47.91 
 
 		 654 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  45.93 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  45.93 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  46.58 
 
 		 631 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  45.49 
 
 		 548 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  45.01 
 
 		 552 aa  402  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  44.5 
 
 		 548 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  47.34 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  47.34 
 
 		 555 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  47.34 
 
 		 555 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  45.1 
 
 		 577 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  44.57 
 
 		 549 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  42.93 
 
 		 566 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  42.63 
 
 		 566 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  44.7 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  43.01 
 
 		 546 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  43.24 
 
 		 545 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  42.25 
 
 		 547 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  44 
 
 		 545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  42.5 
 
 		 546 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  43.57 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  42.04 
 
 		 560 aa  329  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  40.33 
 
 		 666 aa  254  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  32.6 
 
 		 705 aa  253  5.000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  33.53 
 
 		 679 aa  252  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 		 680 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 		 680 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 692 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 692 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 		 667 aa  248  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  33.82 
 
 		 698 aa  244  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 666 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  38.08 
 
 		 770 aa  230  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 		 527 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.3 
 
 		 531 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 757 aa  221  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  38.67 
 
 		 690 aa  221  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 537 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  35.36 
 
 		 653 aa  213  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.18 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  29.51 
 
 		 533 aa  210  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.18 
 
 		 532 aa  209  8e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  30.63 
 
 		 533 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.22 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  36.17 
 
 		 553 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.26 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11700  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  40.49 
 
 		 775 aa  202  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.273812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.69 
 
 		 534 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  32.28 
 
 		 535 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.98 
 
 		 688 aa  197  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  33.03 
 
 		 537 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 425 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  30.06 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  32.12 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.78 
 
 		 524 aa  194  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  29.48 
 
 		 527 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.01 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>