More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4987 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  92.29 
 
 		 379 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  92.29 
 
 		 363 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 363 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 750 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.4 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 739 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  34.23 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 		 398 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  36.93 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  33.18 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  32.43 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.57 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0477  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  33.72 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.83 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  43.22 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  43 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  33.15 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  39.83 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1026  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  28.14 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  28.14 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 395 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.9 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0632  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0264  phosphatidylserine decarboxylase  43.07 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.78 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  36.76 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.74 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>