More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1890 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1890  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  233  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1730  AsnC family transcriptional regulator  81.08 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2400  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3838  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277809  normal  0.961023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3321  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4638  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.51 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2142  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390853  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3584  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4423  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3944  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  38.75 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  33.03 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  29.36 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  29.63 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  32.77 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  35.8 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  31.73 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2201  AsnC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.96 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  38.37 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  34.44 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1442  transcriptional regulator, AsnC family  30.7 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  30 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  37.21 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  31.2 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  31.2 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  31.2 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  37.21 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  31.2 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  31.2 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>