48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3788 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  100 
 
 		 440 aa  910    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  28.13 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  26.87 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  26.87 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  23.87 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  26.96 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  24.25 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  25 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  25.23 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  23.64 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  23.64 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  23.35 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  23.96 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  23.84 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  23.84 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  23.96 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  23.84 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  22.12 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  23.13 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  24.22 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  23.93 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  24.1 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  26.96 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  27.14 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  23.28 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  26.23 
 
 		 340 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  21.5 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  33.33 
 
 		 323 aa  50.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  25.94 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  28.57 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  33.33 
 
 		 219 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  24.44 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2492  initiator RepB protein  20.82 
 
 		 365 aa  47.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  22.22 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  21.52 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  22.13 
 
 		 342 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  25.32 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  25.32 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  25.32 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  25.32 
 
 		 487 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  25.32 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  25.32 
 
 		 454 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  25.32 
 
 		 455 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  25.32 
 
 		 455 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  25.32 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  25.32 
 
 		 455 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  24.72 
 
 		 445 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>