More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3016 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  70.98 
 
 		 224 aa  319  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  70.27 
 
 		 225 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  68.92 
 
 		 223 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  68.64 
 
 		 230 aa  300  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  65.32 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  64.86 
 
 		 224 aa  289  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1139  ABC transporter-related protein  62.9 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1208  ABC transporter related  62.9 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  58.18 
 
 		 246 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  59.81 
 
 		 224 aa  248  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  56.11 
 
 		 227 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.5 
 
 		 227 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  59.72 
 
 		 275 aa  241  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  55.71 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.36 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.58 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  54.05 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  54.05 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  55.66 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.7 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 239 aa  232  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  53.42 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.58 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  50.68 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  51.36 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  51.36 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1367  ATPase  53.39 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 318 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  51.13 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  54.22 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  52.05 
 
 		 227 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 227 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  53.88 
 
 		 232 aa  224  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 220 aa  224  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  51.35 
 
 		 258 aa  223  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  50.69 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  51.6 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  51.6 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1987  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.93 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.68 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  50.68 
 
 		 227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2747  putative lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  55.45 
 
 		 233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 201 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 252 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  52.47 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  51.8 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  49.32 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  50.22 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0890  ABC transporter related  56.6 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999916  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.23 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.23 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.23 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  51.6 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.27 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.23 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1746  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.13 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  50.23 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.23 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  46.36 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>