100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0360 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0703  hypothetical protein  38.81 
 
 
221 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.220568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000529  hypothetical protein  38.12 
 
 
207 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6593  methyltransferase type 12  36.32 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05357  hypothetical protein  38 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0648  hypothetical protein  32.98 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0884  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  24.24 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2052  Methyltransferase type 12  26.62 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2206  hypothetical protein  27.36 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00459198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1292  methyltransferase type 12  26.23 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0144  SAM-binding motif-containing protein  31.58 
 
 
216 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0157  SAM-binding motif-containing protein  30.92 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0164  hypothetical protein  32.71 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.789241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4403  SAM-binding motif-containing protein  31.65 
 
 
218 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3058  methyltransferase type 12  24.74 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  24.38 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.7 
 
 
257 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  32.91 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.01 
 
 
259 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.94 
 
 
287 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.45 
 
 
257 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  33.65 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  33.65 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  33.65 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  33.65 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  33.65 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3310  SAM-binding motif-containing protein  23.96 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0193155  normal  0.377357 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  33.65 
 
 
283 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  33.65 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
270 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.67 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
256 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  28.19 
 
 
225 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0147  hypothetical protein  36.59 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  26.67 
 
 
256 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  40.68 
 
 
504 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.3 
 
 
282 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
195 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.7 
 
 
254 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.07 
 
 
258 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.93 
 
 
258 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.57 
 
 
258 aa  45.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.57 
 
 
258 aa  45.1  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.93 
 
 
256 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0195  hypothetical protein  46 
 
 
262 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478934  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.09 
 
 
260 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.26 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.64 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  36.08 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.72 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.82 
 
 
257 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.45 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  39.02 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  29.89 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.86 
 
 
258 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  36.08 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  46.3 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.77 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.86 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  35.05 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11537  hypothetical protein  37.93 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  34.74 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  27.19 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  30.21 
 
 
461 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
252 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.1 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.91 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  32.11 
 
 
268 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.18 
 
 
256 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  44.26 
 
 
252 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  48.89 
 
 
307 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.64 
 
 
305 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  24.03 
 
 
284 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.8 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
246 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.8 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  25.95 
 
 
307 aa  42  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
226 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.66 
 
 
252 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.66 
 
 
252 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  24.03 
 
 
284 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
194 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3213  hypothetical protein  24.4 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.66 
 
 
252 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.66 
 
 
243 aa  41.6  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  25.66 
 
 
252 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.22 
 
 
252 aa  41.6  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.93 
 
 
227 aa  41.2  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  34.72 
 
 
233 aa  41.6  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.66 
 
 
252 aa  41.6  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  31.17 
 
 
263 aa  41.2  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
273 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>