115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2593 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  99.83 
 
 		 573 aa  1181    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 573 aa  1182    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  48.61 
 
 		 580 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  44.76 
 
 		 563 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  44.76 
 
 		 563 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  43.97 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  44.08 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  49.82 
 
 		 293 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  33.12 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  33.12 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  29.6 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  29.6 
 
 		 596 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  29.4 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  27.22 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  27.22 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  27.22 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  27.22 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  29.14 
 
 		 562 aa  136  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  26.21 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  28.43 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  26.56 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  26.56 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  28.23 
 
 		 562 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  27.73 
 
 		 548 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  27.73 
 
 		 548 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  27.73 
 
 		 548 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  27 
 
 		 559 aa  120  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  27.8 
 
 		 629 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  25.68 
 
 		 561 aa  117  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  26.88 
 
 		 579 aa  109  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  27.12 
 
 		 558 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  25.48 
 
 		 562 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  26.88 
 
 		 558 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  28.91 
 
 		 555 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  29.22 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  29.22 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  23.35 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  23.35 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  23.35 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  23.35 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  23.35 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  28.7 
 
 		 586 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  27.29 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  27.29 
 
 		 578 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  27.06 
 
 		 578 aa  100  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 		 632 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 		 632 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 		 632 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 		 632 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 		 632 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 		 632 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 		 632 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  25 
 
 		 632 aa  95.5  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  27.89 
 
 		 359 aa  95.5  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  25.12 
 
 		 566 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 		 548 aa  89.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 		 596 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  24.33 
 
 		 642 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  26.28 
 
 		 414 aa  87.4  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  22.6 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  27.2 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  25.25 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5679  hypothetical protein  49.4 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  24.66 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  26.01 
 
 		 508 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  22.59 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  22.59 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  26.2 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  26.95 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  24.59 
 
 		 539 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  26.19 
 
 		 275 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  35.37 
 
 		 171 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5699  hypothetical protein  36.46 
 
 		 107 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.410912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  22.19 
 
 		 570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  22.19 
 
 		 570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  22.19 
 
 		 570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  22.19 
 
 		 570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  22.19 
 
 		 570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  21.81 
 
 		 522 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  21.43 
 
 		 417 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  20.37 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  23.04 
 
 		 604 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  22.59 
 
 		 586 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0262  transposase, IS4  20 
 
 		 530 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.952811  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  27.95 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  22.59 
 
 		 604 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  22.59 
 
 		 604 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>