More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2368 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  43.08 
 
 
990 aa  815    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  74.9 
 
 
976 aa  1537    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  75.47 
 
 
983 aa  1539    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  43.75 
 
 
975 aa  830    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  77.13 
 
 
981 aa  1564    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
981 aa  2019    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  75.54 
 
 
979 aa  1568    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  65.2 
 
 
985 aa  1350    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1230  zinc protease  46.69 
 
 
979 aa  855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3516  peptidase M16 domain protein  41.65 
 
 
977 aa  789    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  43.08 
 
 
982 aa  803    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  66.53 
 
 
984 aa  1375    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2263  peptidase M16 domain protein  35.51 
 
 
980 aa  632  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000614686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  33.76 
 
 
1014 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  28.95 
 
 
497 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  29.19 
 
 
501 aa  195  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  27.47 
 
 
494 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  27.49 
 
 
468 aa  183  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 
510 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  28.06 
 
 
532 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  27.47 
 
 
494 aa  179  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  27.14 
 
 
496 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  27.9 
 
 
518 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  25.96 
 
 
550 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  28.96 
 
 
503 aa  171  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  26.12 
 
 
526 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  26.18 
 
 
508 aa  155  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  25.89 
 
 
520 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
493 aa  151  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  26.67 
 
 
526 aa  151  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  26.88 
 
 
539 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  30.23 
 
 
528 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  26.04 
 
 
484 aa  124  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  23.84 
 
 
470 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  22.57 
 
 
494 aa  118  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  21.92 
 
 
477 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  24.81 
 
 
484 aa  115  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.03 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  24.56 
 
 
484 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  23.01 
 
 
501 aa  110  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  23.58 
 
 
493 aa  110  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  23.73 
 
 
455 aa  110  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  24.77 
 
 
499 aa  109  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  24.29 
 
 
489 aa  109  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  22.91 
 
 
470 aa  108  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  21.51 
 
 
921 aa  108  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  23.9 
 
 
459 aa  108  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  24.8 
 
 
453 aa  107  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  21.78 
 
 
947 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  21.85 
 
 
442 aa  106  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  23.31 
 
 
453 aa  106  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  25.88 
 
 
422 aa  106  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  21.85 
 
 
459 aa  106  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.33 
 
 
942 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  24.52 
 
 
514 aa  105  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  24.24 
 
 
448 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  24.24 
 
 
448 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  23.67 
 
 
453 aa  105  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  24.3 
 
 
477 aa  104  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  20.65 
 
 
952 aa  104  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  24.21 
 
 
466 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  26.44 
 
 
479 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  23.92 
 
 
465 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  26.9 
 
 
440 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 
853 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  24.93 
 
 
464 aa  102  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.17 
 
 
506 aa  101  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  24.21 
 
 
530 aa  101  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  20.55 
 
 
959 aa  100  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  24.4 
 
 
460 aa  101  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  23.03 
 
 
934 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  24.84 
 
 
448 aa  99.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  22.89 
 
 
454 aa  99.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  24.68 
 
 
513 aa  100  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  24.9 
 
 
912 aa  98.6  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  22.31 
 
 
492 aa  98.6  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  29 
 
 
428 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  24.23 
 
 
465 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  24.23 
 
 
465 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  21.69 
 
 
947 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  24.75 
 
 
451 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  26.14 
 
 
476 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  24.07 
 
 
459 aa  97.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  25.77 
 
 
448 aa  97.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  24.73 
 
 
454 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  27.03 
 
 
469 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  27.24 
 
 
457 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  25.52 
 
 
948 aa  96.3  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  23.86 
 
 
504 aa  95.5  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  30.27 
 
 
919 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  23.9 
 
 
460 aa  95.1  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  24.02 
 
 
509 aa  95.1  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  23.9 
 
 
460 aa  95.1  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  22.34 
 
 
469 aa  94.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  23.47 
 
 
937 aa  94.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  26.62 
 
 
463 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  26.88 
 
 
441 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  26.84 
 
 
452 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0177  peptidase M16 domain protein  25.1 
 
 
418 aa  93.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  22.45 
 
 
453 aa  93.2  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>