More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2349 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  48.35 
 
 		 1049 aa  751    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  46.05 
 
 		 1201 aa  1021    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  44.62 
 
 		 923 aa  683    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  45.1 
 
 		 1044 aa  705    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 1186 aa  2471    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  49.55 
 
 		 1183 aa  1103    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  46.86 
 
 		 1190 aa  989    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  46.23 
 
 		 1023 aa  728    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  46.3 
 
 		 1041 aa  721    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  46.38 
 
 		 1053 aa  749    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  45.17 
 
 		 1007 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  63.34 
 
 		 1044 aa  1084    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  59.32 
 
 		 1064 aa  1001    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  47.86 
 
 		 1200 aa  1034    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  46.08 
 
 		 1049 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  49.94 
 
 		 965 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  46.54 
 
 		 1492 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  49.27 
 
 		 1581 aa  1127    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  43.24 
 
 		 960 aa  625  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  69.85 
 
 		 775 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  31.49 
 
 		 644 aa  220  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 		 1818 aa  193  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  34.72 
 
 		 267 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  50.33 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.4 
 
 		 908 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  34.58 
 
 		 433 aa  127  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.11 
 
 		 1067 aa  121  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.49 
 
 		 398 aa  120  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.89 
 
 		 1148 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.79 
 
 		 398 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 586 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.24 
 
 		 762 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.24 
 
 		 762 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  40.61 
 
 		 251 aa  113  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.31 
 
 		 444 aa  111  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.72 
 
 		 325 aa  111  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.35 
 
 		 888 aa  111  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.74 
 
 		 517 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.51 
 
 		 997 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  39.01 
 
 		 319 aa  109  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  36.48 
 
 		 417 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.12 
 
 		 829 aa  107  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  27.95 
 
 		 1349 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  33.21 
 
 		 742 aa  106  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.99 
 
 		 751 aa  105  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  30.23 
 
 		 439 aa  105  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  37.89 
 
 		 740 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  22.89 
 
 		 949 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.68 
 
 		 826 aa  104  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  38.5 
 
 		 348 aa  104  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  36.67 
 
 		 390 aa  104  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  38.18 
 
 		 253 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.6 
 
 		 1086 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  37.97 
 
 		 348 aa  103  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  28.21 
 
 		 1339 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.65 
 
 		 1091 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  38.92 
 
 		 263 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  28.68 
 
 		 957 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  31.87 
 
 		 416 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 416 aa  103  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  26.86 
 
 		 1742 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  28.93 
 
 		 766 aa  102  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 		 447 aa  102  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  32.5 
 
 		 444 aa  102  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.62 
 
 		 506 aa  102  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  29.7 
 
 		 338 aa  101  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  25.12 
 
 		 766 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  38.02 
 
 		 1132 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.6 
 
 		 517 aa  99.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  36.69 
 
 		 614 aa  99  4e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  35.36 
 
 		 1392 aa  99  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.67 
 
 		 416 aa  99  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  33.9 
 
 		 273 aa  99  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.37 
 
 		 1345 aa  99  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  39.66 
 
 		 293 aa  98.6  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  31.42 
 
 		 262 aa  98.2  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 		 265 aa  98.2  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  26.08 
 
 		 1237 aa  97.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 861 aa  97.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  32.31 
 
 		 586 aa  97.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 		 265 aa  97.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  37.8 
 
 		 240 aa  96.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  24.58 
 
 		 1002 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  38.89 
 
 		 319 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1080 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  35.29 
 
 		 351 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  34.15 
 
 		 538 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  26.3 
 
 		 2194 aa  95.9  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.02 
 
 		 887 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  30.65 
 
 		 446 aa  95.5  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  36.81 
 
 		 291 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  33.87 
 
 		 819 aa  94.7  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  33.17 
 
 		 654 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.06 
 
 		 818 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  39.29 
 
 		 475 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.31 
 
 		 308 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  26.48 
 
 		 783 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  38.69 
 
 		 616 aa  93.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  33.92 
 
 		 487 aa  92.8  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.76 
 
 		 951 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>