More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2110 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  80.11 
 
 		 383 aa  638    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 378 aa  784    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  59.26 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  56.08 
 
 		 379 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  53.32 
 
 		 378 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  56.99 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  56.2 
 
 		 426 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  55.17 
 
 		 382 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  54.88 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  54.79 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  53.44 
 
 		 379 aa  421  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  53.83 
 
 		 379 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  55.82 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  57.18 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  54.11 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  52.27 
 
 		 377 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  52.01 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  53.7 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  53.32 
 
 		 381 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  51.47 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  50.67 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  52.02 
 
 		 390 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  51.99 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  51.47 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  52.02 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.67 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  51.75 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 378 aa  398  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  51.59 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  50.52 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  51.06 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  51.19 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  51.19 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  51.33 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  51.32 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  50.93 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  51.05 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 377 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  50.79 
 
 		 378 aa  388  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  50.92 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  51.59 
 
 		 394 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  47.89 
 
 		 380 aa  391  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  51.71 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  49.87 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  51.19 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  51.06 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  51.46 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  49.6 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  51.85 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  51.19 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  51.19 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  51.19 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  49.34 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  49.21 
 
 		 383 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  50.53 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  50.13 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  45.74 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  51.32 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  47.48 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0786  cystathionine gamma-lyase  51.33 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  48.54 
 
 		 377 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  49.33 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.54 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  50 
 
 		 388 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  51.06 
 
 		 379 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.06 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  49.47 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  47.72 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 		 390 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  49.47 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  47.48 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  54.35 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  47.75 
 
 		 380 aa  363  4e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  44.97 
 
 		 392 aa  362  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.13 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  47.99 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  48.94 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  52.46 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  50.27 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  49.73 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  49.47 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  46.15 
 
 		 379 aa  359  4e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  47.86 
 
 		 386 aa  358  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  46.68 
 
 		 394 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  47.47 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  49.6 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  47.72 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>