More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0697 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  77.17 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  77.78 
 
 		 127 aa  204  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  76.19 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  79.53 
 
 		 125 aa  197  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  64.57 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  61.42 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  57.48 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  60.16 
 
 		 126 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  55.91 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  55.91 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  56.45 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  52.76 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 127 aa  127  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  47.66 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  43.94 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 126 aa  120  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  43.9 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1055  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.206037  normal  0.46199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  42.06 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  43.65 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  46.55 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  47.24 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  46.34 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  48.46 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  44.26 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  48.62 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>