147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1645 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  53.14 
 
 
271 aa  308  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  35.82 
 
 
305 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  34.21 
 
 
276 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  32.83 
 
 
274 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  33.83 
 
 
276 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  35.21 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  36.19 
 
 
283 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  34.72 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  33.21 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  35.04 
 
 
284 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  34.07 
 
 
281 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  32.94 
 
 
264 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  34.08 
 
 
288 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  31.68 
 
 
272 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  29.96 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  29.96 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  29.96 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  29.96 
 
 
278 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  30.42 
 
 
269 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  30.42 
 
 
269 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  30 
 
 
275 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  32.72 
 
 
289 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  31.2 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  31.2 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  31.2 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  34.93 
 
 
285 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  29.55 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  29.89 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  27.94 
 
 
271 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  28.74 
 
 
266 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  31.72 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  29.66 
 
 
257 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  25.75 
 
 
301 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  27.41 
 
 
284 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  26.27 
 
 
288 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  29.92 
 
 
285 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  25.36 
 
 
287 aa  98.6  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  28.21 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  29.23 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  25.86 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  27.61 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  30.14 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  26.85 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  26.26 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  26.28 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  25.27 
 
 
291 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  26.14 
 
 
284 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  25.82 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  23.08 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  26.14 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  25.28 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  27.98 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  25.37 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  25.48 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  27.65 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.78 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  29.88 
 
 
324 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.89 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  34.35 
 
 
314 aa  62  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  27.72 
 
 
291 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  28.95 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.77 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.66 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  25.98 
 
 
310 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.4 
 
 
360 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.98 
 
 
308 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  28.33 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.35 
 
 
300 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  23.4 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.45 
 
 
294 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  29.23 
 
 
326 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2303  esterase/lipase-like protein  29.27 
 
 
336 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.53 
 
 
300 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  27.56 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  30.5 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  25.7 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3171  Esterase/lipase-like protein  37.35 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.45 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.78 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  26.38 
 
 
412 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  27.42 
 
 
303 aa  53.1  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  26.38 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  26.38 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  26.38 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  26.38 
 
 
315 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  26.38 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.67 
 
 
301 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.67 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  27.5 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.42 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  29.11 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  26.02 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.46 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.89 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1292  esterase/lipase  30.6 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  33.33 
 
 
300 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.77 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  30.43 
 
 
279 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  28.68 
 
 
334 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>