108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1018 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 		 89 aa  186  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  82.02 
 
 		 87 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  68.42 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  74.07 
 
 		 67 aa  93.2  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  55.56 
 
 		 80 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  74.07 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  74.07 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  74.07 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  74.07 
 
 		 80 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  74.07 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  74.07 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  71.7 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  69.81 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  53.85 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  64.81 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  66.04 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  66.04 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  45.45 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  47.62 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  47.62 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  43.04 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  48.39 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  39.74 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  45.31 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  44.78 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  43.28 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  44.78 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  40.32 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  48.28 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  47.73 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  47.73 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  41.18 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  48.84 
 
 		 267 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  38.98 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  45.45 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  47.83 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  43.18 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  43.18 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  44.9 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  43.75 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  39.66 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  43.75 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  44.26 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  44.26 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  44 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  44.26 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  35.38 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  44.19 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  42.19 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  40.82 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  45.45 
 
 		 102 aa  43.9  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  40.43 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  45.65 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  42 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  45.45 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  38.89 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  39.53 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  47.73 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  46.34 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  37.74 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  45.45 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  34.69 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  36.67 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  45.45 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  37.1 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  37.1 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  39.02 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  39.22 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  37.1 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  41.03 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  41.46 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  43.4 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  36.59 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  39.53 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  37.29 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  47.73 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  43.18 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  38.18 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  44 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  42.22 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  37.1 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  48.57 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  40.48 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  38 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  36.21 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  37.7 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  41.3 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>