More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0514 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 377 aa  758    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  74.01 
 
 		 377 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.11 
 
 		 454 aa  212  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  31.24 
 
 		 452 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  33.87 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.87 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  33.06 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  34.68 
 
 		 383 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.8 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.96 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.89 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.71 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  30.93 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.98 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  31.83 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  32.57 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.22 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  30.79 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.19 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  32.29 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.59 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  34.74 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.83 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  34.21 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.64 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.11 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  34.21 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  33.51 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  32.44 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.11 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  33.86 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  30.4 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  28.91 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  31.71 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.38 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  32.97 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  32.11 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.76 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  30.65 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 		 367 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.5 
 
 		 350 aa  169  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  30.79 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.27 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  30.21 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  30.73 
 
 		 352 aa  165  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  31.2 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  28.38 
 
 		 438 aa  162  7e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.61 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  30.48 
 
 		 369 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2253  hypothetical protein  29.44 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.37 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  36.49 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.83 
 
 		 368 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  36.44 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.48 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2281  hypothetical protein  29.35 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.81 
 
 		 339 aa  156  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  29.55 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  30.38 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  38.2 
 
 		 462 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.2 
 
 		 462 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  38.62 
 
 		 462 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  40.17 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  31 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.39 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.2 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  40.17 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.16 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  27.22 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  37.3 
 
 		 456 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  48.05 
 
 		 450 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  29.69 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.94 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.45 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.51 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  39.41 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.07 
 
 		 455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.41 
 
 		 452 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.41 
 
 		 450 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  31.06 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.76 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.18 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.45 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  46.41 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.86 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  38.74 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.98 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.24 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  30.21 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.02 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  29.59 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  29.44 
 
 		 348 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.14 
 
 		 455 aa  142  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  46.41 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4941  membrane-associated zinc metalloprotease  40.61 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  33.62 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  37.14 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.14 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>