More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2751 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 549 aa  1115    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.84 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3901  GTP-binding protein HSR1-related  24.72 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368648  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.25 
 
 		 589 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  25 
 
 		 1415 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  33.09 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.33 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  26.36 
 
 		 564 aa  64.3  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.1 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  32.37 
 
 		 585 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26 
 
 		 583 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  33.09 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  33.85 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  32.37 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  32.88 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  29.7 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  32.12 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  33.82 
 
 		 300 aa  57  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 298 aa  57  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.74 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 308 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  31.18 
 
 		 324 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  36.67 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  32.26 
 
 		 298 aa  55.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  34.71 
 
 		 326 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 305 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3902  GTP-binding protein HSR1-related  30.17 
 
 		 829 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12168  normal  0.150325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01718  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 285 aa  55.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.515078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  31.87 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  38.82 
 
 		 312 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  31.97 
 
 		 297 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  29.59 
 
 		 297 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  28.21 
 
 		 303 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  28.89 
 
 		 443 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  32.14 
 
 		 308 aa  54.7  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  35.66 
 
 		 440 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3193  GTP-binding protein, HSR1-related  29.78 
 
 		 1211 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  29.05 
 
 		 311 aa  53.9  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  29.05 
 
 		 311 aa  53.9  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  34.68 
 
 		 448 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  29.23 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  37.19 
 
 		 527 aa  53.9  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  33.5 
 
 		 515 aa  53.9  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  29.23 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  32.79 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.7 
 
 		 438 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  32.85 
 
 		 436 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  32.99 
 
 		 531 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  35.83 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  33.61 
 
 		 468 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  38.33 
 
 		 496 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  29.83 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  34.59 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  47.37 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  30.38 
 
 		 296 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  31.72 
 
 		 305 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  37.08 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  30.83 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 		 354 aa  52  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  28.69 
 
 		 308 aa  52  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  34.15 
 
 		 319 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.91 
 
 		 614 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.91 
 
 		 614 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  31.36 
 
 		 298 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  34.56 
 
 		 311 aa  52  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  28.21 
 
 		 453 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  30.57 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  29.66 
 
 		 322 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  37.35 
 
 		 314 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  33.05 
 
 		 320 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  35 
 
 		 516 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  33.06 
 
 		 459 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  34.65 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  33.33 
 
 		 444 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  28.65 
 
 		 301 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  39.18 
 
 		 443 aa  51.2  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  31.67 
 
 		 440 aa  51.2  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 		 511 aa  51.2  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  39.18 
 
 		 443 aa  51.2  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  32.61 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 315 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  28.31 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  30.41 
 
 		 473 aa  50.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  34.75 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  29.93 
 
 		 300 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  32.48 
 
 		 305 aa  50.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2440  GTP-binding protein Era  33.62 
 
 		 316 aa  50.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  31.15 
 
 		 440 aa  50.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  33.72 
 
 		 297 aa  50.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  31.58 
 
 		 483 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  33.61 
 
 		 477 aa  50.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 463 aa  50.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 300 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  30.41 
 
 		 451 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  30.87 
 
 		 462 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  30.33 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  26.97 
 
 		 301 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  29.76 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  30.89 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>