More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2026 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  666    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  87.03 
 
 
318 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  84.28 
 
 
318 aa  571  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  83.28 
 
 
319 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  82.59 
 
 
319 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  81.33 
 
 
319 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  81.01 
 
 
319 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  80.76 
 
 
319 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  79.75 
 
 
317 aa  542  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  73.4 
 
 
312 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  74.04 
 
 
314 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  66.67 
 
 
317 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  62.54 
 
 
315 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  56.65 
 
 
315 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  41.14 
 
 
312 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.52 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  36.76 
 
 
347 aa  92.4  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 
358 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
358 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
355 aa  87  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 
364 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  36.81 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  31.18 
 
 
387 aa  86.3  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
366 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.18 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  29.87 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.28 
 
 
346 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.7 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  29.39 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.12 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  34.06 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  33.81 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  37.86 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.16 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  27.68 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  35.56 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  31.88 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.02 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  34.25 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  29.02 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.33 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  33.33 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  33.33 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  33.33 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  33.33 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  25.69 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  34.27 
 
 
400 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3807  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
371 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
377 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.23 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  26.29 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.2 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.51 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  29.55 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.2 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.64 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.18 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  26.64 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.6 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>