59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1284 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  59.46 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  53.67 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  54.28 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  54.83 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  51.38 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  48.86 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  48.64 
 
 		 263 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  39.55 
 
 		 263 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  41.31 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  32.2 
 
 		 200 aa  122  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  34.52 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  32.24 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  31.43 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  29.95 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  33.66 
 
 		 332 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  24.25 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  28.8 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.26 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  25.64 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  27.03 
 
 		 407 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  34.72 
 
 		 330 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  34.72 
 
 		 330 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  25.23 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  22.11 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.15 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2847  putative hydrolase  35.71 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 		 462 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  35.62 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  29.65 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  23.05 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 334 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 363 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  26.91 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  34.25 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  27.75 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.06 
 
 		 367 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>