More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1866 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1866  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1057    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  30.63 
 
 		 562 aa  238  1e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  28.98 
 
 		 573 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  28.57 
 
 		 573 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.83 
 
 		 562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  29.05 
 
 		 557 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  29.04 
 
 		 554 aa  224  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  26.95 
 
 		 559 aa  224  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  33.21 
 
 		 560 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 566 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 532 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  29.15 
 
 		 577 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  28.57 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1194  DNA repair protein RecN  28.89 
 
 		 555 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.544631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  29.62 
 
 		 556 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  28.26 
 
 		 555 aa  217  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 558 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.7 
 
 		 567 aa  216  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 		 562 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  27 
 
 		 593 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.23 
 
 		 579 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  29.64 
 
 		 565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  27.6 
 
 		 574 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  29.54 
 
 		 572 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  27.92 
 
 		 554 aa  213  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  28.27 
 
 		 579 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  28.3 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  28.28 
 
 		 555 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  28.09 
 
 		 579 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  28.14 
 
 		 579 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  28.09 
 
 		 583 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  28.27 
 
 		 579 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  27.59 
 
 		 575 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  29.6 
 
 		 565 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  28.09 
 
 		 583 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  28.89 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  28.37 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  27.61 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.34 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  28.09 
 
 		 579 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  28.09 
 
 		 579 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  29.41 
 
 		 565 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 555 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  26.97 
 
 		 567 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  27.74 
 
 		 523 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  28.75 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  27.32 
 
 		 577 aa  205  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  25.7 
 
 		 590 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  29.89 
 
 		 551 aa  204  4e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  29.09 
 
 		 582 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.68 
 
 		 551 aa  203  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  26.8 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  28.39 
 
 		 556 aa  200  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  26.9 
 
 		 553 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  26.9 
 
 		 553 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  26.9 
 
 		 553 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  28.39 
 
 		 608 aa  200  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  28.65 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  26.81 
 
 		 553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 		 570 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  25.74 
 
 		 558 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  26.06 
 
 		 549 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  30.46 
 
 		 550 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  28.11 
 
 		 572 aa  197  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  29.29 
 
 		 553 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  28.67 
 
 		 557 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  25.69 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  25.69 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  25.69 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  25.69 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  25.69 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  33.03 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  25.69 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  30.29 
 
 		 561 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  28.32 
 
 		 557 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  27.85 
 
 		 529 aa  194  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  27.66 
 
 		 601 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  26.45 
 
 		 553 aa  193  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  25.5 
 
 		 549 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 599 aa  193  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  28.05 
 
 		 552 aa  192  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  26.19 
 
 		 553 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  28.83 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  25.46 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  26.19 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  26.19 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  28.7 
 
 		 560 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  25.72 
 
 		 549 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  26.19 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  26.19 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  29.01 
 
 		 592 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  26.19 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  25.64 
 
 		 605 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  26.19 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  27.72 
 
 		 557 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  28.29 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  26.37 
 
 		 554 aa  190  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  28.41 
 
 		 586 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  30.51 
 
 		 557 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  25.27 
 
 		 549 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>