27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1768 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  35.18 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  33.89 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  32.33 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  32.83 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  34.84 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  33.62 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  33.86 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  33.91 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  31.46 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  35.89 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  32.64 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  30.9 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  34.89 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  32.23 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  33.19 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  30.04 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  29.46 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  33.76 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  27.67 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  27.6 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  27.09 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  27.41 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  25.1 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  25.1 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  25.1 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1005  CRISPR-associated Cas family protein  24.16 
 
 		 230 aa  45.4  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>