60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1447 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 
394 aa  807    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  43.29 
 
 
397 aa  359  5e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  43.62 
 
 
397 aa  359  6e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  45.76 
 
 
390 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  45.13 
 
 
389 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  27.39 
 
 
445 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  27.25 
 
 
445 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  23.95 
 
 
396 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  24.38 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  26.64 
 
 
390 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  26.68 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  24.32 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  24.66 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  25.82 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  31.21 
 
 
528 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  22.16 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  25.46 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  23.61 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  23.61 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  31.01 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  27.23 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  21.99 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  22.64 
 
 
426 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  29.29 
 
 
481 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  22.64 
 
 
426 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  22.29 
 
 
430 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  23.63 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  24.76 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  29.14 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  21.31 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  28.67 
 
 
488 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  24.15 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  26.74 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  26.74 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  27.66 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  21.94 
 
 
608 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  23.82 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  26.53 
 
 
427 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  20.05 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  28.12 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  26.35 
 
 
459 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  27.03 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7571  hypothetical protein  34.67 
 
 
473 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  30.71 
 
 
456 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  24.32 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4249  hypothetical protein  32.95 
 
 
475 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.482803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  27.59 
 
 
797 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  23.49 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  27.7 
 
 
459 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  21.54 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  24.32 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  22.01 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  32.32 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  25.6 
 
 
460 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  20.06 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  24.71 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  22.02 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  25 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  26.15 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  24.75 
 
 
477 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>