46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1061 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  88.99 
 
 
422 aa  773    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  100 
 
 
436 aa  902    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  58.06 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  56.36 
 
 
222 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  30.09 
 
 
481 aa  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  32.7 
 
 
459 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  31.63 
 
 
459 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  32.56 
 
 
464 aa  163  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  29.93 
 
 
452 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  35.12 
 
 
427 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  32 
 
 
477 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  31.15 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  33.72 
 
 
427 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  35.33 
 
 
461 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  30.36 
 
 
471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  34.12 
 
 
459 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  30.65 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  31.11 
 
 
438 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  29.25 
 
 
465 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  29.7 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  35.8 
 
 
427 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  30.5 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  30.09 
 
 
387 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  30.09 
 
 
388 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  28.7 
 
 
459 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  34.51 
 
 
234 aa  106  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  27.65 
 
 
422 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5452  hypothetical protein  28.64 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197178  normal  0.0385521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0812  hypothetical protein  43.02 
 
 
199 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00116474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  21.69 
 
 
471 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  21.69 
 
 
471 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0119  putative type IV secretion system protein IcmJ/DotN  35.35 
 
 
239 aa  53.1  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  40.85 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  43.48 
 
 
221 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4433  hypothetical protein  49.12 
 
 
190 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  50.94 
 
 
80 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  50.94 
 
 
80 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  41.94 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  40.32 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  38.71 
 
 
299 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  47.17 
 
 
81 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  37.04 
 
 
163 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  35.38 
 
 
84 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  36.11 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  31.31 
 
 
174 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  26.45 
 
 
174 aa  43.5  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>