More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1193 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1193  DedA family protein  100 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1189  SNARE associated Golgi protein  59.43 
 
 		 214 aa  268  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.260888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1018  DedA family protein  60.66 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1374  DedA family protein  56.07 
 
 		 215 aa  232  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1183  SNARE associated Golgi protein  60.75 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1106  SNARE associated Golgi protein  51.18 
 
 		 212 aa  201  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1436  DedA family protein  50 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.95 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.02 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  29.11 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  32.76 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  30.86 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  30 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5402  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.93 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  30.96 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  31.46 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  27.6 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  32.54 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26.51 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  28.65 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  28.06 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  31.65 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  26.84 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  27.12 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.89 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  27.27 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.05 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  26.19 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0736  alkaline phosphatase  35.37 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  29.88 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.74 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  25.12 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  28.42 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  22.7 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  29.17 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  29.1 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.24 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  28.42 
 
 		 678 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  26.9 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  27.55 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  28.42 
 
 		 678 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  27.42 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  32.35 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  29.8 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.43 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  27.69 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  32.35 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  31.12 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  26.9 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  25.13 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  26.23 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  28.95 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  29.21 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  22.71 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  25.77 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  28.65 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.65 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  28.65 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  28.65 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  28.65 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  28.65 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  28.65 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  23.47 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  25.12 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  28.83 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  28.93 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  28.09 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  28.09 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  27.27 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  28.16 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  29.21 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  28.09 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.93 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  24.24 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  28.09 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  28.09 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  26.77 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  26.77 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  28.09 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  28.36 
 
 		 682 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  26.32 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  28.36 
 
 		 682 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.02 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.4 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  22.49 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  24.04 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  28.31 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  23.74 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0187  DedA  35.62 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0175955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>