More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2198 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 359 aa  742    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  47.55 
 
 		 350 aa  346  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  46.35 
 
 		 366 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  44.73 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  45.43 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  42.53 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  45.95 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  40.23 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  40.9 
 
 		 358 aa  258  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  39.39 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  39.14 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  42.49 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  39.12 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  35.11 
 
 		 359 aa  226  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 		 356 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  37.36 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  38.81 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  36.16 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  35.46 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  33.89 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  35.48 
 
 		 331 aa  206  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  34.9 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 		 350 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  33.81 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  36.39 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  34.01 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  31.1 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  34.1 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  33.81 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  33.62 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  31.23 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  33.66 
 
 		 357 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.87 
 
 		 404 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 361 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  28.09 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  34.43 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.49 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.33 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  30.11 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  29.19 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  27.38 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  26.32 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  28.7 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  30.2 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.6 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  23.78 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>