More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0321 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  51.79 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  51.76 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  50.25 
 
 		 201 aa  210  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  51.24 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  54.27 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.25 
 
 		 197 aa  204  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.26 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  49.5 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.25 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.74 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.97 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.46 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.35 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.9 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.45 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.5 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.71 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.32 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.15 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.22 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  46.5 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.5 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.7 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  39.8 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  41.58 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  41 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  36.68 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  39.81 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1306  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.92 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1173  isopropylmalate isomerase small subunit  40.39 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  39.32 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  38.83 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  36.71 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  39.18 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  38.34 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  37.44 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.44 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  37.44 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  35.27 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  37.44 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  37.44 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  37.44 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  37.44 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  36.95 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.47 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  36.95 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  38.98 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  37.5 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  35.68 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  37.81 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  40.34 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  37.68 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  39.6 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  37.5 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  37.29 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  37.5 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  37.2 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  42.67 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  37.2 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  43.87 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  43.23 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  35.75 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.41 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  38.98 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  43.23 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2521  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.71 
 
 		 210 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0949356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  35 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  40.78 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  40.61 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  37.29 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2131  isopropylmalate isomerase small subunit  44.97 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  37.19 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  38.12 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  38.07 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  39.77 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  40.78 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  40.78 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  40.78 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  38.07 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  37.7 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.64 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5901  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.35 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  38.07 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  36.71 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  36.76 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  41.94 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.63 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  37.38 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  41.25 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.25 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  37.19 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>