More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2757 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  67.54 
 
 		 341 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  66.15 
 
 		 360 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  68.45 
 
 		 367 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  59.8 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  63.35 
 
 		 309 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  63.35 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  58.64 
 
 		 194 aa  225  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  58.64 
 
 		 194 aa  225  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  58.64 
 
 		 194 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  59.26 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  61.26 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  60.1 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  57.81 
 
 		 192 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  60.21 
 
 		 200 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  59.38 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  49.3 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  49.3 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  58.79 
 
 		 200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  57.59 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  61.46 
 
 		 335 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  58.64 
 
 		 194 aa  210  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  57.59 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  59.16 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  59.16 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  50.7 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  53.68 
 
 		 189 aa  205  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  51.64 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  48.83 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  49.77 
 
 		 217 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  49.77 
 
 		 217 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  46.95 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  53.93 
 
 		 193 aa  194  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  52.72 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  52.06 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  48.34 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  50.26 
 
 		 192 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  45.16 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  46.95 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  47.69 
 
 		 229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  45.66 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  50.53 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  44.34 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  46.23 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  47.44 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  48.69 
 
 		 192 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  46.23 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  52.36 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  50.54 
 
 		 182 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  44.34 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  47.6 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  43.63 
 
 		 423 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  47.34 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  47.78 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  47.2 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.6 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  50.27 
 
 		 192 aa  174  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  45.07 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  45.28 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  44.55 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  43.4 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  45.79 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  45.79 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  42.25 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  43.4 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  44.98 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  41.31 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  42.65 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  46.81 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  44.39 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  45.11 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  47.59 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  45.26 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  44.04 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  44.97 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  45.5 
 
 		 191 aa  168  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  47.09 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  41.78 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05122  Adenylate kinase 1 (AK 1)(EC 2.7.4.3)(ATP-AMP transphosphorylase 1)(Adenylate kinase cytosolic and mitochondrial) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V8]  41.63 
 
 		 259 aa  167  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  44.44 
 
 		 181 aa  167  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12732  predicted protein  44.04 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  41.31 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  43.58 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  41.35 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  42.25 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  42.79 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  48.13 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  43.41 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.9 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  41.94 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.41 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  45.5 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  45.5 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  46.56 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  45.5 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  43.48 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  39.91 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.12 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  46.88 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37399  predicted protein  43.24 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.889133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>