More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0474 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
292 aa  604  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  57.35 
 
 
309 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  58.82 
 
 
300 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2696  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.52 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4282  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.32 
 
 
328 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1270  enoyl-CoA hydratase  48.6 
 
 
302 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00698519  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0976  enoyl-CoA hydratase  45.99 
 
 
312 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0994  enoyl-CoA hydratase  45.99 
 
 
312 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1004  enoyl-CoA hydratase  45.99 
 
 
312 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10687  enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
312 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0780  enoyl-CoA hydratase  47.5 
 
 
300 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0927737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0606  enoyl-CoA hydratase  47.52 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0557731  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0615  enoyl-CoA hydratase  47.52 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0628  enoyl-CoA hydratase  47.52 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756527  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10462  enoyl-CoA hydratase  45.52 
 
 
304 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.4 
 
 
296 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  40.42 
 
 
297 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0341  enoyl-CoA hydratase  37.68 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0636518  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5505  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
293 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0321  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
287 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317267  normal  0.269459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
280 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
275 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 
257 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
258 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
264 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
258 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
258 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
251 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1464  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.24 
 
 
279 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.710715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
262 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 
269 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23444  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
259 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0566  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 
273 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000469467  normal  0.441502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.14 
 
 
290 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
272 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
259 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
271 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 
267 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
259 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.76 
 
 
260 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
269 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
259 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.62 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 
257 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
263 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3592  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
262 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.91 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
295 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
259 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
257 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
318 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.45 
 
 
662 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  33.93 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.75 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.48 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  34.89 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.74 
 
 
252 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 
257 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.33 
 
 
662 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>