More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3480 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
958 aa  1961    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  34.6 
 
 
946 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  32.2 
 
 
986 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  32.87 
 
 
981 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.65 
 
 
962 aa  462  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  32.42 
 
 
967 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  31.45 
 
 
962 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  31.45 
 
 
962 aa  456  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  32.05 
 
 
982 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  31.45 
 
 
962 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  28.68 
 
 
939 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  29.42 
 
 
962 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 
947 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  29.61 
 
 
962 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  28.4 
 
 
925 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  29.42 
 
 
962 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  29.71 
 
 
962 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  30.01 
 
 
960 aa  415  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  29.2 
 
 
962 aa  412  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  29.12 
 
 
962 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  29.53 
 
 
962 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  29.12 
 
 
962 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  29.12 
 
 
962 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  29.12 
 
 
962 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  28.17 
 
 
929 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  28.17 
 
 
929 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  29.2 
 
 
962 aa  412  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  29.12 
 
 
962 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  29.12 
 
 
962 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  29.12 
 
 
962 aa  412  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  28.15 
 
 
929 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  29.38 
 
 
929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  29.19 
 
 
929 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  28.17 
 
 
929 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  28.16 
 
 
929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  29.76 
 
 
929 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  29.02 
 
 
929 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  29.87 
 
 
925 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  28.84 
 
 
929 aa  399  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  29.13 
 
 
941 aa  399  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  29.24 
 
 
929 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  29.12 
 
 
929 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 
929 aa  396  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  27.76 
 
 
904 aa  392  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  29 
 
 
929 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  27.63 
 
 
929 aa  386  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  26.89 
 
 
968 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  28.83 
 
 
936 aa  357  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  27.18 
 
 
963 aa  316  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  26.74 
 
 
1100 aa  311  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  25.72 
 
 
945 aa  296  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  26.45 
 
 
995 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  26.23 
 
 
1162 aa  279  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  25.56 
 
 
915 aa  278  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  27.37 
 
 
1074 aa  277  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  25.4 
 
 
1008 aa  257  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  25.37 
 
 
952 aa  227  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  27.57 
 
 
1272 aa  206  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  21.85 
 
 
916 aa  197  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  22.42 
 
 
939 aa  167  8e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  30.36 
 
 
762 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  28.38 
 
 
779 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  29.23 
 
 
1246 aa  131  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  27.53 
 
 
808 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  29.05 
 
 
766 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  29.11 
 
 
775 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.48 
 
 
760 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  29.79 
 
 
763 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.11 
 
 
794 aa  108  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  28.47 
 
 
766 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  30.73 
 
 
809 aa  105  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  30.93 
 
 
419 aa  92.8  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  23.9 
 
 
447 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  30.93 
 
 
419 aa  92  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  29.25 
 
 
932 aa  90.1  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  29.9 
 
 
419 aa  90.1  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  29.41 
 
 
423 aa  89.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  25.07 
 
 
422 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  28.5 
 
 
418 aa  88.2  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2952  peptidase M16 domain protein  26.72 
 
 
430 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  28.97 
 
 
843 aa  87.4  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  24.01 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  24.01 
 
 
441 aa  86.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  23.58 
 
 
453 aa  86.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  24.58 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  23.97 
 
 
469 aa  84  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  28.89 
 
 
433 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  26.01 
 
 
979 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  29.33 
 
 
433 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  22.88 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  25.21 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  26.03 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  24.4 
 
 
443 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3480  peptidase M16 domain protein  25.21 
 
 
411 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0177  peptidase M16 domain protein  25.17 
 
 
418 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  25.08 
 
 
426 aa  80.1  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  27.98 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  26.01 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3238  peptidase M16 domain-containing protein  27.27 
 
 
431 aa  79  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  23.85 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>