128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3651 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  100 
 
 		 400 aa  797    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  67.25 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  61.76 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  59.09 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  57.97 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  58.5 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  53.42 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  51.77 
 
 		 396 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  45.84 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  48.88 
 
 		 421 aa  346  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  46.85 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  46.84 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  45.71 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  45.34 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  43.14 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  43.14 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  43.24 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  43.24 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  43.24 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  43 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  43 
 
 		 425 aa  322  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  43 
 
 		 425 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  43 
 
 		 425 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  43 
 
 		 425 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  43 
 
 		 425 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  43 
 
 		 425 aa  322  9.000000000000001e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  42.75 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  42.75 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  43.33 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  43.08 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  37.38 
 
 		 411 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  37.8 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  34.68 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  33.91 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  33.99 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  33.91 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  33.01 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  33.01 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  33.01 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  33.01 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  33.01 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  33.01 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  33.5 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  33.25 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  33.25 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  33.25 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  33.25 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  33.25 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  33.25 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  33.25 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  33.01 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  35.99 
 
 		 418 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  35.99 
 
 		 418 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  35.99 
 
 		 418 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  35.99 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  35.75 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  32.37 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  33.82 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  33.69 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  33.82 
 
 		 418 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  31.41 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  29.31 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  29.68 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  25.94 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  26.28 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.99 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  23.08 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  24.28 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>