136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2080 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2080  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 438 aa  902    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5699  acetamidase/formamidase  80.65 
 
 		 439 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1338  Acetamidase/Formamidase  54.46 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.702518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2184  Acetamidase/Formamidase  54.46 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4177  acetamidase/formamidase  51.89 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3508  acetamidase/formamidase  52.35 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3153  acetamidase/formamidase  52.11 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.121817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3284  Acetamidase/Formamidase  52.36 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148354  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2642  Acetamidase/Formamidase  50.47 
 
 		 437 aa  441  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0651  Acetamidase/Formamidase  50 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2016  Acetamidase/Formamidase  49.77 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.62129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1872  Acetamidase/Formamidase  49.77 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  36.13 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  36.13 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  36.13 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  36.13 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  36.13 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  35.59 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  35.29 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  34.45 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  34.75 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  33.9 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  30.87 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  33.8 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  32.86 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  32.86 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  32.86 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  33.1 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  32.8 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  26.29 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  46.15 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  43.08 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  41.79 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.83 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  29.59 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  32.88 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  44.19 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  34.45 
 
 		 360 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  34.48 
 
 		 305 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  30.14 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  30.83 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 777 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  29.56 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  35.9 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  27.41 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  40 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  24.88 
 
 		 347 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  35.29 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  29.22 
 
 		 332 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  34.45 
 
 		 312 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  37.35 
 
 		 328 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  30.7 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  35.8 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  43.33 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  29.51 
 
 		 311 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  28.23 
 
 		 318 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.95 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.95 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  28.95 
 
 		 319 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  23.27 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  27.59 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  25.3 
 
 		 291 aa  50.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  40.3 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  32.26 
 
 		 300 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  23.37 
 
 		 791 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  28.57 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  24.55 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 810 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  27.59 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 791 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  23.42 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  23.49 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  28.47 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  30.77 
 
 		 775 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  32.88 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  26.54 
 
 		 285 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  40.74 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  40 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  31.25 
 
 		 345 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  28.65 
 
 		 316 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  29.2 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  38.81 
 
 		 350 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  26.54 
 
 		 285 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  38.98 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  40.68 
 
 		 409 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  23.13 
 
 		 483 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  40.3 
 
 		 342 aa  46.6  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  40 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  24.9 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  37.93 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  40.68 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  40.68 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  40.68 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.77 
 
 		 791 aa  46.6  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  24.83 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  33.6 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  40.68 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  40.68 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  38.98 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>